На сегодняшний день из различных организмов выделено более 200 антимикробных пептидов, причем более 170 из них получены только из насекомых. Эти пептиды классифицируются на основе их происхождения и структурных свойств.
Линейные пептиды со спиральной структурой
Цекропины были первыми обнаруженными противомикробными пептидами животных; они были выделены из куколок американского шелкопряда (*Hyalophora cecropia*) Boman et al. в 1980 году.
Линейные пептиды, богатые специфическими аминокислотами.
Апидецины — это-богатые пролином пептидные антибиотики, выделенные из медоносных пчел. Обычно они состоят из 16–18 аминокислотных остатков, при этом содержание пролина достигает до 33%, а аргинина — до 17%. Апидецины проявляют сильную активность против некоторых грамотрицательных бактерий, но неэффективны против грам-положительных бактерий.
Пептиды, содержащие одну дисульфидную связь
Это небольшой класс антимикробных пептидов. Первым обнаруженным пептидом этого типа был бактенецин, полученный из бычьих нейтрофилов. Он содержит 12 аминокислот-включая четыре остатка аргинина-и образует дисульфидную связь между вторым и одиннадцатым остатками.
Пептиды, содержащие две и более дисульфидные связи
Дефензины являются прототипными представителями этого класса. Первоначально обнаруженные -дефензины, полученные из тканей млекопитающих, обычно содержат 29–34 аминокислотных остатка; шесть консервативных остатков цистеина образуют три внутримолекулярные дисульфидные связи. Кроме того, консервативны остатки аргинина в положениях 6 и 15, а также остаток глицина в положении 24.
Лантибиотики
Лантибиотики – это пептидные антибиотики, продуцируемые бактериями; они генетически кодируются, синтезируются на рибосомах и подвергаются пост-трансляционной модификации, включающей в себя определенные органические группы. Среди них наиболее изучен низин.